政府是推動醫療信息化發展的核心。政府能夠通過政策、資金、技術、知識傳播等，協調市場和醫院推動醫療信息化的發展。如國務院 2009 年頒布《關于深化醫療衛生體制改革的意見》，2018 年組建衛健委和醫保局等從政策和機構層面推動醫療信息化的發展。如教育部 2003 年批準 32 個院校設立醫學/衛生信息管理本科從知識傳播等角度促進了醫療信息化的發展。
財政投入與醫保政策刺激醫療信息化從醫院管理信息系統（HIS）跨越到醫院臨床信息系統（CIS）。HIS 以財務管理為核心，支持醫院的行政管理和事務處理。CIS 包含電子病歷系統（EMR），醫學影像系統（PACS），實驗室信息管理系統（LIS）等，著眼于支持醫院醫護人員的臨床活動。2003 年前后，SARS 刺激財政醫療投入，疊加全國醫保、新農合開始實施推動醫院臨床信息系統（CIS）發展。
醫改和互聯互通需求刺激區域醫療衛生信息化（GMIS）建設。新醫改明確信息化是“四梁八柱”中的一根支柱。醫療體系中的“孤島”和 “煙囪”系統（如孤立的醫院）無法與周圍系統溝通，需要建立區域醫療信息化平臺促進設立信息數據標準，實現互聯互通。
