燃料電池物流車具備高載重、續航長、加氫快和環保等優勢，非常契合中長途重載運輸場景。現今主流城市快遞配送網絡模式主要是“城際-分撥中心/倉庫-網點-終端用戶”，其中“城際-一級分撥中心-二級網點”的支干線運輸主要由中重型貨車承擔；“二級網點-終端用戶”以及最后一公里配送的短駁/支線運輸主要由載重 1t 左右的微輕型貨車或者電動兩輪車承擔。燃料電池物流車載重一般都大于 2t，續航 300-700km，加氫時間 5-10 分鐘，具備路權優勢，非常適合中長途距離的支干線運輸。
當前補貼情況下，燃料電池物流車經濟性優于燃油物流車。在地補為國補0.6 倍情況下，燃料電池汽車使用成本為 1.67 元/km，與燃油物流車成本持平；部分地區地補與國補持平，燃料電池物流車經濟性優于燃油物流車。未來伴隨氫氣價格和燃料電池動力總成成本下降，燃料電池物流車經濟性將更加突出。
伴隨燃料電池產業化，氫氣價格和燃料電池動力總成成本下降，燃料電池物流車可以有節奏應對補貼退坡，未來經濟性將更加突出。到 2020 年補貼不退坡，燃料電池動力總成成本下降 50%，氫氣 30 元/kg，燃料電池物流車全生命周期成本相對燃油物流車低 67%；到 2025 年地補完全退坡，燃料電池動力總成成本下降 90%，氫氣 28 元/kg，燃料電池物流車全生命周期成本相對燃油物流車低 61%。
