新醫改政策是我國第一批醫療信息化建設的主要推力。2009-2013 年，我國醫療信息化建設受益于“新醫改”政策的出臺，呈現高速增長態勢。在衛生信息化“十二五”規劃中，政府明確提出建立電子健康檔案和電子病歷數據庫，推動了我國以 EMR 為核心的醫院信息平臺建設。
醫院信息平臺建設成果豐碩。在這期間，我國醫院信息平臺建設取得了長足的發展。據了解，我國三級醫院基本達到醫院信息系統全覆蓋，而二級及以下也基本達到 80%覆蓋，67%的縣已建成區域檢驗檢查暨影像中心。在上海、浙江、安徽、重慶等最先開放的試點地成果頗豐。
HIS 與醫院管理運作有關，以醫院事務管理為主要內容，如病人的醫療費用管理，藥品的庫存、發放管理，人事檔案管理等，數據采集和處理較為簡單。它包括門急診、住院、藥事、財務及物流等子系統，發展較早，滲透率較高。
CIS 與臨床醫療護理有關，以醫療過程為主要內容，如電子病歷、專家診療系統，涉及醫療經驗的推理和決策過程，難度更大。它包括醫生護士工作站、EMR、LIS、RIS、PACS 等子系統，發展較晚，滲透率較低。
HIS 滲透率較高。新醫改期間，我國醫院信息化建設主要以 HIS 為主。根據 CHIMA 統計，2015 年我國 HIS 已實施比例接近 80%，其中門急診劃價收費、藥庫管理等核心系統已實施比例在 75%以上，且近五年來變動率不大。
