醫院管理信息化（HIS）階段。以收費為中心，實現醫院非醫療業務的信息化管理，具體包括門急診系統、住院系統、藥事系統、財務及物流系統和其他輔助系統。其中門急診系統實現了利用計算機網絡對收費、掛號、分診等工作流程進行信息化管理，有助于提升醫院日常事務的經營效率并為實現醫療業務的信息化管理奠定基礎。
醫院臨床醫療管理信息化（CIS）階段。以患者為中心，聚焦醫生臨床診療行為，進而實現對手術、診療等醫院核心醫療業務的信息化管理，具體包括醫生護士工作站、電子病歷系統（EMR）、實驗室信息管理系統（LIS）、放射科信息管理系統（RIS）和影像歸檔的通信系統（PACS）等子系統。其中電子病歷系統（EMR）是 CIS 階段的重點建設項目，是指用電子設備保存、管理、傳輸和重現病人的醫療記錄，完成電子化匯總，從而取代手寫紙張病歷。此外影像歸檔的通信系統（PACS）具有一定的輔助診斷功能，有助于提升醫生工作效率。
區域醫療衛生服務（GMIS）階段。以居民電子健康檔案為核心，實現醫療機構、衛生主管部門、保險機構、家庭等多渠道信息的互通互聯，消除單個機構的信息孤島，實現資源共享、優化。GMIS建設的前提是醫院內部 HIS、CIS 系統建設已經有一定的基礎，具體包括雙向轉診、分級診療、居民電子健康檔案等子系統。其中居民電子健康檔案旨在構建居民在醫療衛生服務、健康體檢和疾病調查等活動中具有保存備查價值的電子化歷史記錄，以減少物理資源的消耗，實現醫療機構、患者、衛生管理部門之間的信息共享。持續、動態更新的電子健康檔案有助于醫療機構、衛生主管部門實時掌握居民的健康信息，并針對高危人群實施有效的防治措施。當發生意外時，可通過電子健康檔案迅速查詢病人過往的健康情況，從而采取及時正確的急救措施，挽救病人生命。未來隨著大數據、人工智能技術的應用，醫療信息化會朝著更加智能化的方向發展。
