以學科評估能力，清北并列第一。根據教育部第四次學科評估，評估結果按“分檔”方式呈現，具體方法是按“學科整體水平得分”的位次百分位，將前 70%的學科分 9 檔公布：前 2%（或前 2 名）為 A+，2%～5%為 A（不含 2%，下同），5%～10%為 A-，10%～20%為 B+，20%～30%為 B，30%～40%為 B-，40%～50%為 C+，50%～60%為 C，60%～70%為 C-。
位于 A+的學科是我國高校中的王牌學科，清北并列第一。此次學科評估中，共有 513 個高校和科研單位的 7449 個學科參評，全國高校具有博士學位授予權的學科有 94%申請參評。其中共有 81 所高校的 228 個學科獲評 A+(中國科學院大學作為科研單位參評)，其中清華大學、北京大學作為我國的王牌大學繼續領跑，各有 21 個學科獲評 A+，并列居首，中國科學院大學和浙江大學各有 18 個和 11 個學科獲評 A+，分列三、四位，中國人民大學有 9 個學科獲 A+，列第五位。除此之外，中國科學技術大學、北京師范大學、中國農業大學、復旦大學、上海交通大學、東南大學 6 所高校，各有 5 至 7 個學科獲評 A+。
北京無論數量規模還是質量結構，均位列主導地位。從各省份學科評估成績來看，北京處于遙遙領先的位臵，C-以上學科約占全國的 1/8，A 以上學科約占全國 1/4，A+學科約占全國1/2；上海市在 C-檔以上學科總數不如江蘇省，但在 A-檔以上的優質學科和 A+檔學科上具有一定優勢。在 C-檔以上學科總數上，排在第 4 到第 10 位的省份分別是湖北、陜西、山東、廣東、遼寧、浙江、湖南。在 A+檔和優質學科方面，湖北省和浙江省分別列在第 4 位和第 5位。表現較好的還有湖南、安徽、陜西、黑龍江、四川、山東、廣東等省。遼寧省 C-以上學科總數位居全國前列，但無 A+學科，A 和 A 學科也較少。重慶、河北也缺少 A 以上的高端學科。
